| 获奖年度 | 获奖名称 | 主要完成人 | 获奖类别 | 获奖等级 |
| 2008 | 抗HIV药物研发关键技术建立及其应用 | 郑永唐 杨柳萌 王睿睿 张高红 王云华 欧阳东云 王媛媛 | 云南省科技成果奖(科技进步类) | 1 |
| 2008 | 云南省HIV毒种库建设及分子流行病学研究 | 郑永唐 | 云南省科技成果奖(科技进步类) | 3 |
| 2008 | 灵长类核移植与干细胞的研究 | 季维智 牛昱宇 杨世华 李天晴 王淑芬 和协超 唐向辉 谢云华 陈永昌 纪少珲 | 云南省科技成果奖（自然科学类) | 2 |
| 2008 | 两栖动物活性多肽的结构与功能研究 | 赖仞 张云 李建许 张亚平 郑永唐 徐学清 杨海龙 李文辉 | 云南省科技成果奖（自然科学类) | 1 |
| 2007 | Y染色体多态性欲东亚人群的起源、迁徙和遗传结构的研究 | 宿兵（2） | 国家自然科学奖 | 2 |
| 2007 | 牛、羊胚胎工程产业化技术体系研发及应用 | 苏雷 季维智 文际坤 赵家明 马晓宁 和协超 和占星 王姝瑭 王鹏武 徐松 杨玉梅 | 云南省科学技术奖 | 2 |
| 2007 | 中国人群氧化抑制物遗传多态性与COPD关系研究 | 张亚平 孙昌 | 云南省科学技术奖(科技进步类) | 3 |
| 2007 | 基于少数民族DNA库的疾病基因及人群起源的分子遗传研究 | 宿兵（3） | 云南省科技成果奖（自然科学类) | 1 |
| 2006 | 尖吻蝮蛇毒凝血酶的临床前基础研究 | 肖昌华 李建云 杨连玺 何丽芬 杨怀林 杨建珍 冉永禄、 叶文娟等。 | 云南省科技成果奖(技术发明类) | 3 |
| 2006 | 鱇鱼良白鱼的人工驯养繁殖研究 | 杨君兴 顾和生 陈银瑞 李跃先 李再云 周 能 刘明昌 刘吉祥 刘元增 | 云南省科技成果奖(技术发明类) | 3 |
| 2006 | 云南省静脉吸毒人群HIV与HCV共感染和新型HIV重组流行株的发现及产生机理的研究 | 贲昆龙、武部礼、杨荣阁、张驰宇、夏雪山、草川茂 | 云南省科技成果奖（自然科学类) | 2 |
| 2006 | 线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究 | 张亚平、姚永刚、孔庆鹏、丁远春、孙昌 | 国家自然科学奖 | 2 |
| 2005 | 云南汉族人TNF-a基因启动子多态性与寻常型银屑病的研究 | 张亚平 孙昌 | 云南省科学技术奖(科技进步类) | 3 |
| 2005 | 癌基因和抑癌基因在乳腺癌发生中的作用的分子病理研究 | 张亚平 | 云南省科学技术奖(科技进步类) | 1 |
| 2005 | 中国少数民族DNA库的建立及应用研究 | 宿兵 | 云南省科学技术奖(自然科学类) | 1 |
| 2005 | 蛇毒免疫排斥抑制剂－CVF研究 | 王婉瑜 熊郁良 孙黔云 吕秋敏 李东升 朱绍文 魏勤 金扬 魏继福 贾永红 陈润强 周兴丁 吴健波 李瑞 | 云南省科技成果奖(科技进步类) | 3 |
| 2005 | 云南热泉高温菌资源开发利用的基础研究 | 贲昆龙 | 云南省科学技术奖(自然科学类) | 3 |
| 2005 | 线粒体基因组多样性与东亚人群历史的研究 | 张亚平、姚永刚、孔庆鹏、丁远春、孙昌 | 云南省科技成果奖（自然科学类) | 1 |
| 2005 | 核骨架与核纤层的起源进化研究 | 文建凡 李靖炎 陈万群 何德 | 云南省科技成果奖（自然科学类) | 2 |
| 2005 | 张亚平 | 张亚平 | 云南省科技成果奖(突出贡献类)) | 1 |
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