中国科学院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心（以下简称“卓越中心”）为中科院2017年11月批准成立的依托于中科院昆明动物研究所的非法人机构。作为中科院体制与机制改革的试点，是跨学科、跨院校的组织；旨在以科学问题为导向，凝聚中科院的科研实力，通过团队合作和学科交叉融合聚焦动物进化和遗传交叉重大科学问题。中心将以国家“一带一路”倡议为契机，聚焦动物进化和遗传交叉重大科学问题，以动物复杂性状和多样性组学解析为突破口，以重大国际合作计划和“动物复杂性状的进化解析与调控”B类先导专项为牵引，以“灵长类动物表型与遗传研究”国家重大科技基础设施为抓手，解决关系国家和区域发展的基础性、战略性、前瞻性科技问题，开拓和引领生命科学研究新方向、新范式，成为动物进化与遗传交叉领域的国际顶尖卓越科学中心与人才集聚高地。  

领域一     基因组多样性与适应性进化  

           科学问题：动物多样性的格局与演化机制    

           研究重点：聚焦进化关键变革节点，聚焦重点区域动物多样性；利用高通量组学，特别是基因组学思路和手段；阐明生态系统和生物圈动物多样性的组成和成因，开展动物物种、种群、生态系统的基因组学研究，绘制重要动物类，群基因组层面的生命之树；解决关系国家和区域发展的生物多样性资源保护与利用研究中的基础性、战略性、前瞻性科技问题。     

领域二      性状进化与遗传解析   

            科学问题：动物复杂性状产生和进化的遗传创新机制    

            研究重点：以动物复杂性状为研究对象，通过进化生物学与遗传学的交叉融合，全面揭示代表性复杂性状的内在遗传驱动力、发育调控网络的组成及其与环境的相互作用机制，深入系统地剖析动物复杂性状的成因，实现动物复杂性状的可追溯、可预测和可调控，取得复杂性状研究的显著理论突破，建立具有普适意义的复杂性状eGPS研究新范式，引领和推动复杂性状的研究。    

领域三     关键理论和技术   

       科学问题：解决生物多样性与复杂性状研究中的关键理论与技术问题    

       研究重点：解决动物复杂性状和生物多样性组学研究中的关键技术难题。建立跨物种、多组学、异质、高维大数据的产出与整合的理论和方法，创建生物多样性基因组学的理论和技术体系。搭建灵长类表型与遗传研究系统，建立与完善高效的非传统模式物种基因编辑与功能分析平台，为解析动物复杂性状提供坚实的技术支撑。