1.通过基因组学分析，揭示亚洲叶猴类重层社会系统的进化历史 

 川金丝猴属于独特的的重层社会进化，由一夫多妻制单元聚合而形成几百只个体的大群在森林中生活。通过对奇鼻猴类动物各代表种高质量的三代全基因组测序，结合行为生态学、灵长类学的大数据信息，以及比较基因组学和生物信息学分析，还原叶猴重层社会系统亚洲起源和聚合的具体过程，从不同层面回答非人灵长类社会系统适应性进化的科学问题。 

2.通过宏基因组学分析，揭示金丝猴食性适应性进化的机制 

 秦岭川金丝猴是现生疣猴类分布的最北界，发现它们面临比较长时间的落叶期和冬季低温，在采食行为上不但没有选择纤维少的食物，反而选择了相对更难消化的树皮作为落叶期食物，暗示其在消化系统进化上可能有与以往进化理论不一样的消化系统的进化策略。通过对仰鼻猴属不同区域种群个体全基因组和宏转录组进行对比研究，探究宿主在代谢和消化酶功能对食性时空差异的应答特征和机理，从而揭示川金丝猴和仰鼻猴属消化适应机制。  

 Qi XG, Garber PA, Ji WH, Huang ZP, Huang K, Zhang P, Guo ST,Wang XW, He G, Zhang P,Li BG*. 2014. Satellite telemetry and social modeling offer new insights into the origin of primate multilevel societies.Nature Communication,5:5296. DOI:10.1038/ncomms6296. 

Yang B, Anderson JR,Li BG*.2016. Tending a dying adult in a wild multilevel primate society.Current Biology, 26, R403-R404. 

Yang B, Anderson JR, Zhang P,Li BG*.2016. Save the world’s primates in peril.Science (Letter), 354(6311):425.(doi:10.1126/science.aak9638). 

Qi XG*, Huang K, Fang G, Grueter CC, Dunn DW, Li YL, Ji WH, Wang XY, Wang RT, Garber PA,Li BG*. 2017. Male cooperation for breeding opportunities contributes to the evolution of multilevel societies.Proceedings of the Royal Society B. 284: 20171480. 

Huang K, Ritland K, Dunn DW, Qi XG, Guo ST,Li BG*. 2016. Estimating relatedness in the presence of null alleles.Genetics, 202:247-260.