动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心

李家堂

李家堂，1980年1月生，博士，研究员，中国科学院成都生物研究所。

个人简介　

2010年5月-2012年9月中国科学院成都生物研究所两栖爬行动物研究室助理研究员；

2012年10月-2014年10月中国科学院成都生物研究所两栖爬行动物研究室副研究员；

2014年11月-至今，中国科学院成都生物研究所两栖爬行动物研究室研究员；

2015年11月-2016年11月美国德克萨斯州立大学奥斯汀分校访问学者；

2009年10月-2014年12月中国科学院昆明动物研究所做博士后研究。

先后主持或承担国家自然科学基金委优秀青年基金、国家自然科学基金委面上项目、中科院“西部之光”创新交叉团队、中科院青年拔尖人才项目和中科院战略性先导科技专项（B类）等多项科研项目。现任Asian Herpetological Research杂志编委，中国科学院青年创新促进会生命分会会长，中国动物学会两栖爬行动物学分会常务理事，四川省科青联常务理事和四川省动物学会理事。曾获第十四届四川省青年科技奖，第六届中国动物学会青年科技奖，中国科学院卢嘉锡青年人才奖，四川省第十一批学术技术带头人后备人选。

主要研究方向及内容

1.两栖爬行动物系统学研究

发现和描述新的物种；分子系统发育研究，生物地理学与进化生物学等研究。

2. 全基因组解析物种适应极端环境的分子机制

自然选择促进多样的生物类群衍生出多样的适应策略，从而实现物种内基因的不断延续与种群的顺利繁衍。两栖爬行动物迁移能力弱并且对环境的依赖性强，在特殊环境下成功地衍生出相应的特殊适应策略而生存和发展。两栖爬行动物中具有特殊适应策略的类型多样，这些生活在极端环境下的物种，由于对其独特的生活环境逐渐产生了适应，在形态、行为、遗传上都产生了适应性相关的性状。运用比较基因组学、转录组学、细胞及分子生物学实验方法，整合多组学数据、表型数据和分子与细胞生物学实验数据，得到与极端环境适应相关的候选基因，并对候选基因进行生物学功能验证，综合探讨生物适应极端环境的分子机制。

代表性论文

Ren JL, Wang K, Tao TN, Chung VH, Zhong GH, Jiang K, Guo P, Li JT*. 2018. Taxonomic re-evaluation of the monotypic genus Pararhabdophis Bourret, 1934 (Squamata: Colubridae: Natricinae) with discovery of its type species, P. chapaensis, from China. Zootaxa, 4486(1), 031-056.

　　Li JT^#*, Gao YD^#, Xie L^#, Deng C, Shi P, Guan ML, Huang S, Ren JL, Wu DD, Ding L, Huang ZY, Nie H, Humphreys DP, Hillis DM^*, Wang WZ^*, Zhang YP^*. 2018. Comparative genomic investigation of high-elevation adaptation in ectothermic snakes. Proceedings of the National Academy of Sciences, 115(33), 8406-8411.

　　Lv YY, He K, Klaus S, Brown MR, Li JT*. 2018. A comprehensive phylogeny of the genus Kurixalus (Rhacophoridae, Anura) sheds light on the geographical range evolution of frilled swamp treefrogs. Molecular Phylogenetics and Evolution, 121, 224-232.

　　Dang NX, Wang JS, Liang J, Jiang DC, Liu J, Wang L, Li JT*. 2018. The specialisation of the third metacarpal and hand in arboreal frogs: Adaptation for arboreal habitat? Acta Zoologica, 99(2), 115-125.

　　Ren JL, Wang K, Jiang K, Guo P, Li JT*. 2017. A new species of the Southeast Asian genus Opisthotropis (Serpentes: Colubridae: Natricinae) from western Hunan, China. Zoological Research, 38(05), 251-263.

　　Klaus S*, Morley RJ, Plath M, Zhang YP, Li JT*. 2016. Biotic interchange between the Indian subcontinent and mainland Asia through time. Nature Communications, 7(4), 12132.

　　Li JT*, Wang JS, Nian HH, Litvinchuk SN, Li Y, Rao DQ*, Klaus S. 2015. Amphibians crossing the Bering Land Bridge: evidence from holarctic treefrogs (Hyla, Hylidae, Anura). Molecular Phylogenetics and Evolution, 87, 80-90.

　　Li JT*, Li Y, Klaus S, Rao DQ, Hillis DM*, Zhang YP*. 2013. Diversification of rhacophorid frogs provides evidence for accelerated faunal exchange between India and Eurasia during the Oligocene. Proceedings of the National Academy of Sciences, 110, 3441-3446.

　　Li JT, Liu J, Chen YY, Wu JW, Murphy RW, Zhao EM, Wang YZ*, Zhang YP*. 2012. Molecular phylogeny of the Rhacophorus dugritei species complex (Anura: Rhacophoridae), with descriptions of two new species. Zoological Journal of the Linnean Society, 165, 143-162.

　　Li JT, Li Y, Murphy RW, Rao DQ*, Zhang YP*. 2012. Phylogenetic resolution of the Asian tree frogs, Rhacophorus (Rhacophoridae, Amphibia). Zoologica Scripta, 41(6), 557-570.

　　Li JT, Che J, Murphy RW, Zhao H, Zhao EM, Rao DQ*, Zhang YP*. 2009. New insights to the molecular phylogenetics and generic assessment in the Rhacophoridae (Amphibia: Anura) based on five nuclear and three mitochondrial genes, with comments on the evolution of reproduction. Molecular Phylogenetics and Evolution, 53(2), 509-522.

　　Li JT, Che J, Bain RH, Zhao EM*, Zhang YP*. 2008. Molecular phylogeny of Rhacophoridae (Anura): a framework of taxonomic reassignment of species within the genera Aquixalus, Chiromantis, Rhacophorus and Philautus. Molecular Phylogenetics and Evolution, 48(1), 302-312.